Mô-đun NLC-MOD-USB lắp tại khe số 1 và kết nối bộ điều khiển Nanoline với cổng USB của máy tính để truyền dữ liệu hoặc cấu hình phần mềm. Thiết bị hoạt động như một giao diện nối tiếp USB, hỗ trợ tốc độ đến 115,2 kbit/s và cần trình điều khiển đi kèm nanoNavigator. Giao diện trên mô-đun là USB Type-B, dùng cùng cáp USB phù hợp.
